Tugas Review Jurnal
Tugas Review Jurnal Bio-informatika perikanan budidaya
“SKRINING BAKTERI VIBRIO SP ASLI
INDONESIA SEBAGAI PENYEBAB PENYAKIT UDANG BERBASIS TEHNIK 16S RIBOSOMAL
DNA"
Jurnal ini merupakan jurnal
yang berkaitan dengan bioinformatika organisme akuatik dan bertujuan untuk
menganalisis jenis dari bakteri vibrio yang
sering kali menyerang organisme akuatik, terutama pada udang budidaya. Serangan
dari bakteri vibrio dapat
merugikan pembudidaya udang. Salah satu teknik yang terbaik untung
mengidentifikasi bakeri ini adalah dengan mengetahui struktur DNA, yaitu dengan
teknik sekuens 16S rDNA.
Vibrio yang
teridentifikasi dari jurnal ini antara lain Vibrio alginolyticus, Vibrio
parahaemolyticus, Vibrio harveyi, Vibrio shilonii, dan Vibrio vulnificus.
beberapa dari bakteri ini sudah terdaftar secara internasional dalam gen bank
dunia. Tetapi dari segi toksik belum diteliti lebih lanjut tentang tingkat
kemampuan bahaya yang ditimbulkan dari serangan bakteri ini terhadap udang dan
organisme budidaya lainnya.
Pengamatan yang
dilakukan secara langsung diidentifikasi
(secara morfologi)
antara lain : pengamatan
bentuk sel, warna
koloni, ukuran koloni dan tipe koloni. Selain itu, uji coba biokimia juga
dilakukan terhadap uji bakteri. Uji morfologi maupun uji biokimia yaitu :
Pewarnaan Gram, Pertumbuhan pada Medium TSI Agar, Uji Katalase, uji Oksidase,
Uji Metil Red, Isolasi DNA Vibrio, Reaksi Polimerisasi Berantai, Elektroforesis
dan Pengamatan Hasil PCR, Purifikasi Gel Elektroforesis, Sekuensing dan Analisis
BLAST, Analisis BLAST dilakukan dengan mengedit urutan DNA hasil sekuensing dengan
menterjemahkan N menjadi basa. Semua isolat Vibriomenunjukkan hasil oksidase
dan katalase positif. Uji menggunakan medium agar TSI untuk memperlihatkan terjadinya
fermentasi glukosa dan sukrosa serta gas HS dengan memperhatikan warna pada
agar miring dan agar tegak. Semua isolat adalah Glukosa positif sedangkan untuk
sukrosa, A,C dan E adalah negatif dan sisanya adalah positif.
Hasil dari penelitian
ini sangat bermanfaat dan membantu petani udang untuk menanggulangi serangan
bakteri vibrio, karena dengan mengetahui jenis dari bakteri vibrio
yang ada di tambak, petani udang dapat
menanggulangi serangan dari bakteri vibrio sedini mungkin dan untuk menghindari kerugian akibat serangan bakteri vibrio
ini. Mengetahui jenis bakteri vibrio
yang menggunakan teknik sekuens rDNA
yang menyerang udang budidaya ini dapat bermanfaat untuk menambah wawasan dan
menambah informasi gen dari jenis bakteri vibrio asli indonesia yang diambil dari perairan tambak Jepara, karena dengan
mengetahui jenis vibrio yang
ada diperairan tersebut dapat membantu para akuakulturis untuk menanggulangi
seranagan dari bakteri vibrio.
cemungguuutttttt eaaa.....
ReplyDelete